La biodiversité remarquable des eaux douces et marines

75 % de la superficie des fonds marins entre 0 et - 50 m des eaux territoriales bretonnes abrite des habitats remarquables d'intérêt européen.

Champs de maërl ou de zostère, substrats durs couverts de riches biocénoses ou biodiversité spécifique des sables peu profonds, estuaires ou vasières d'estran, tous ces habitats sont considérés d'intérêt européen et concernés par la directive européenne "Habitats".

Cette richesse et diversité permet sans doute d'accueillir sur nos côtes les populations reproductrices de phoque gris, de veau marin et de grand dauphin.

Les cours d'eau bretons abritent des espèces remarquables et d'intérêt européen comme la loutre, le castor, la mulette perlière et 6 espèces de poisson grand migrateur au cycle de vie partagé entre eau douce et marine.

Limites de la carte.
La directive "Habitats" utilisent une certaine nomenclature des milieux sous marins (exemple sur la légende de carte : "1130", "1140"...). Ces définitions, pertinentes à l'échelle européenne et surtout pour les mers froides du nord-est atlantique, pourraient être affinées afin de mieux tenir compte des spécificités régionales bretonnes. Un travail est en cours, piloté par l'Ifremer.
Malgré leur importance patrimoniale, les fonds marins de type "roche mère en place" ou "chaos rocheux" restent sous échantillonnés en termes d'inventaires de faune et flore à l'échelle régionale. Ainsi les sites prospectés actuellement, notamment dans le cadre du programme Rebent, ne permettent pas de faire un bilan et encore moins une cartographie régionale de cette biodiversité remarquable.